Перед учеными разных специальностей часто встает вопрос о времени появления конкретной группы растений или животных. На этой неделе открылся масштабный проект, который призван помочь найти ответ на подобные вопросы. Новая база данных под названием «Классификация ископаемых останков» будет доступна всем желающим в режиме онлайн. Этот некоммерческий ресурс хранит тщательно проверенные данные палеонтологических находок, совершенных в разное время. Проект явился результатом многолетней работы международной группы исследователей во главе с профессорами Дэниелом Ксепка (Daniel Ksepka) из Музея Брюс в Гринвиче (Великобритания) и Джеймса Пархама (James Parham), руководителя Центра археологии и палеонтологии имени Джона Купера в Калифорнии (США). О проекте сообщается на сайте BruceMuseum.
По словам Дэниела Ксепки, окаменелости представляют важные данные, которые позволяют датировать многие эволюционные события. Новый ресурс позволит найти данные нужного ископаемого, необходимые для уточнения возраста групп растений и животных, о которых не осталось надежных записей в палеонтологической летописи. Например, база располагает сведениями, которые позволяют понять, когда на Земле появились первые певчие птицы, цветущие растения или морские черепахи, а также какие эволюционные процессы происходили в это время, и что влияло на появление видов.
Метод определения филогенетических явлений, называемый «молекулярными часами», основан на теории, согласно которой процесс замещения мономеров в нуклеиновых кислотах, а также в аминокислотах, входящих в состав белков, протекает с постоянной скоростью.
В создании электронной базы данных принимали участие палеонтологи, молекулярные биологи и программисты из разных стран — всего более двадцати человек. Сайт базы данных запущен во вторник, 24 февраля, а статья, в которой подробно описан процесс разработки, будет опубликована в специализированном журнале Palaeontologia Electronica. К слову, профессор Ксепка является членом редколлегии этого издания.
Профессор Пархам, один из создателей проекта, говорит, что изучение процесса расхождения в ходе эволюции и появления новых видов является чрезвычайно захватывающим занятием. Однако зачастую из-за разнобоя в датировках, указываемых в палеонтологической летописи, оно бывает затруднено или вовсе ошибочно. Появление единого бесплатного ресурса, содержащего всю актуальную информацию, будет важным подспорьем для ученых со всего мира. База данных позволяет определить место каждого известного вида, когда-либо жившего на Земле, в «дереве жизни», которое понимается исследователями как общая родословная всего живого на планете.
Ранее "Мир дикой природы" уже писал о еще одной геоинформационной палеонтологической безе данных.
Источник: Научная Россия
В современных научных исследованиях биологического профиля все шире используются географические информационные системы (ГИС). Например, геоинформационные технологии успешно применяют при изучении закономерностей пространственно-временного распределения биологических объектов с учетом особенностей окружающей среды. Обычно ГИС используются для анализа текущих событий и/или прогноза будущих, но они также удобны для изучения ископаемых объектов, условий жизни в далеком прошлом, изменения биоразнообразия и выяснения исторических закономерностей эволюции биосферы.
Для палеонтологов разработали геоинформационную систему Удобство ГИС в комплексных палеонтологических исследованиях объясняется тем, что они совмещают функциональность систем управления базами данных, редакторов растровой и векторной графики и разнообразных аналитических средств.
За последние десятилетия палеонтологических исследований найдено очень большое количество окаменелостей, относящихся к множеству видов животных, растений, микроорганизмов. Для комплексного качественного анализа этой информации уже мало просто нарисовать на бумажной карте какое-то количество точек. Наибольшей эффективности анализа можно достичь путем создания базы данных и интеграции ее с ГИС. Но если еще не так давно каждый исследователь или отдельный научно-исследовательский институт старались делать свои собственные, как правило, небольшие базы данных, содержащие информацию, собранную только ими, то теперь актуальным представляется принципиально новый подход, автоматизирующий множество операций и объединяющий усилия множества ученых и научных коллективов из разных стран мира. Проекты, реализующие на практике такие подходы, уже существуют. Одним из них может считаться Paleobiology Database (Палеонтологическая база данных), в работе над которой принимали участие 350 специалистов из 133 институтов в 24 странах. На данный момент база содержит сведения более чем о миллионе находок остатков ископаемых организмов, является открытой и доступной для использования на основе лицензии Creative Commons.
Этот проект прямо на своем сайте предлагает возможность выборки информации по нескольким параметрам и визуализации ее на карте. Так как с помощью предлагаемого интерфейса нельзя указать для выборки множество дополнительных параметров, и к тому же многие исследователи хотят не только посмотреть на предлагаемой карте что-то, но и "потрогать руками" данные, нанести их на свои собственные карты и проанализировать своими инструментами, то Paleobiology Database предлагает удобный API (интерфейс программирования приложений).
Но очевидно, что далеко не каждый палеонтолог желает тратить свое время на то, чтобы разбираться в том, как запрограммировать выборку из базы данных и как затем нанести выбранное на географическую карту. Помощь в этом палеонтологам предлагает открытый ГИС-проект OpenWebGIS. C помощью этой онлайн-ГИС можно легко и быстро осуществить выборку из палеобиологической базы данных и одним кликом нанести результаты на карту. В качестве такой карты могут выступать Google Maps, OpenStreetMap или собственная векторная карта, если ее предварительно загрузить на сервер OpenWebGIS. Далее исследователь может сам настроить легенду отображения данных, произвести математический анализ из довольно широкого инструментария, предлагаемого в пункте меню "Вычисления" и получить наглядную картинку для сохранения на диске или печати, а также экспортировать результат в KML, GML, JSON, GPX для возможной работы в других ГИС системах.
В качестве примера анализа информации из палеонтологической базы данных с помощью OpenWebGIS можно рассмотреть карту, показывающую родовое разнообразие инфраотряда зауропод (Sauropoda) в виде пространственного распределения количества родов по 10 градусным квадратам. Данная карта получена путем нанесения на нее выборки с параметром "таксон" равным Sauropoda, без ограничения по временным периодам, с последующим приведением количества родов, встретившихся в каждом квадрате к его центру (пункт меню "Расчет по квадратам"), и построения тепловой карты (интерполяции) (пункт меню "Интерполяция") по этим величинам.
Аналогичным образом пользователи могут делать собственные выборки и автоматически наносить их на карту с помощью пункта меню OpenWebGIS "ГеоБазыДанных" -> "Палентологическая база данных". Подобное совместное использование онлайн палеобиологической базы данных и ГИС дает современному палеонтологу удобный инструмент для быстрого и нересурсоемкого (не надо устанавливать на свой компьютер никакого дополнительного программного обеспечения) анализа большого объема информации.
Источник: PaleoNews
27-09-2012 Просмотров:10211 Новости Зоологии Антоненко Андрей
Несмотря на отработанные веками схемы социального паразитизма, муравьям-рабовладельцам часто приходится иметь дело с непокорностью муравьёв-рабов, которые перестают заботиться о господском потомстве, а то и вовсе убивают личинок своих хозяев. Муравьи-рабы атакуют...
27-01-2020 Просмотров:3066 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей
Ученые с помощью современных молекулярных методов нашли следы древнейших грибов в породах неопротерозойского возраста (715−810 миллионов лет). Это на 250 миллионов лет старше любых других известных окаменелостей грибов. Описание приведено...
25-02-2015 Просмотров:8350 Новости Экологии Антоненко Андрей
Ученые впервые вычислили, сколько фосфора содержится в пыли, которая переносится из пустыни Сахара в бассейн Амазонки. Оказывается, что «естественного удобрения», поступающего из Сахары, достаточно для восполнения потерь этого элемента в...
15-02-2013 Просмотров:11659 Новости Нейробиологии Антоненко Андрей
О прионах принято говорить как о безусловном зле: эти белки, склонные принимать альтернативные пространственные формы, вызывают тяжелейшие и неизлечимые неврологические заболевания, которые неизбежно ведут к смерти. Хотя классические прионные болезни...
13-10-2016 Просмотров:13593 Четвероногие (Tetrapoda) Антоненко Андрей
Надкласс: Четвероногие (Tetrapoda) Научная классификация Без ранга: Вторичноротые (Deuterostomia) Тип: Хордовые (Chordata) Подтип: Позвоночные (Vertebrata) Инфратип: Челюстноротые (Ghathostomata) Надкласс: Четвероногие (Tetrapoda) Класс: Млекопитающие (Mammalia) † Синапсиды (Synapsida) Птицы (Aves) Пресмыкающиеся (Reptilia) Земноводные (Amphibia) Оглавление 1. Общие сведения о Четвероногих животных 2. Происхождение Четвероногих животных 3. Классификация Четвероногих животных 1. Общие сведения о Четвероногих животных Примеры четырёх современных...
Скелет десятиметрового динозавра обнаружен в центральной части Египта. Находка сделана в оазисе Харга в провинции Новая Долина в центре Ливийской пустыни, передает во вторник египетское издание Masrawy. Найденные останки МансурозавраОстанки жившего…
Формирование залежей никеля на территории современного Норильска примерно 252 миллиона лет назад могло вызвать мощнейшее вымирание в истории Земли, погубившее 90% видов животных, говорится в статье, опубликованной в журнале PNAS. Флора и фауна пермского периодаУченые…
Если нынешнего Homo Sapiens переместить на нынешний Марс, несчастный погибнет по множеству причин. В первых рядах этих человекоубийц окажется радикальное — в сотню раз — падение атмосферного давления по сравнению…
Представьте: гуляя по лесу, вы натыкаетесь на медведя. Ситуация ужасная, верно. А если вы были не один, а с другом? Уже чуть получше, потому что мишка вполне может заняться вашим…
Зоологи Фэй Кларк и Лорен Смит из Королевского ветеринарного колледжа и Зоологического института в Лондоне (оба — Великобритания) обнаружили, что шимпанзе получают удовольствие от интеллектуальной работы, даже если не имеют…
Когда жуки-навозники катят шарики навоза к своему гнезду, время от времени они забираются на них и выполняют своеобразный танец. Этот танец весьма занимал учёных, и не так давно они, кажется,…
Генетический код вируса возрастом как минимум 19 миллионов лет обнаружили в ДНК зебровой амадины учёные из Техасского университета в Арлингтоне (UT Arlington). Находка относится к той же группе, что и…
Американские палеонтологи открыли карликового динозавра, обитавшего неподалеку от Северного полюса. Этот родственник тираннозавров сумел приспособиться к экстремальным условиям высоких широт и стал "самым полярным" из известных науке гигантских ящеров. Полярный динозавр…
Уникальная пустыня Намиб, расположившаяся прямо на берегу Атлантического океана, сформировалась благодаря пескам реки Оранжевая. Она так и росла с юга на север вдоль побережья. Пустыню Намиб породили река и течение…